Мутация для коронавируса, как и для любого другого организма, дело нормальное, ведь он приспосабливается к условиям внешней среды. Тем не менее, этот патоген меняться бесконечно не может, и рано или поздно, должен прекратить мутацию. Но когда это произойдет?
Пока наука ищет новые средства от SARS-CoV-2, он мутирует, изменяя свой геном, таким образом приспосабливаясь к внешним раздражителям. За время пандемии ученые изучили все детали того, как происходит эволюция в реальном времени. В ходе исследований было выявлено более двух миллионов последовательностей генома вируса SARS-CoV-2.
В итоге был проведен анализ мельчайших эволюционных изменений - такое ранее никогда не было возможным ни для одного реплицирующегося биологического агента за пределами лаборатории. Полученные данные позволили ученым установить примерный прогноз того, когда коронавирус перестанет изменяться.
Известно, что геном SARS-CoV-2 состоит из 30 000 индивидуальных оснований. Скорость, с которой возникают мутации, обычно выражается как вероятность того, что любое индивидуальное основание будет ошибочно заменено при репликации генома.
Период заражения происходит в течение пяти-семи дней. За это время вирус совершает три-семь «циклов репликации» (шагов от первоначального прикрепления к клетке-хозяину до генерации и высвобождения вновь синтезированных вирусных частиц). Пять циклов репликации приведут к примерно 0,5 мутаций, или к одной новой мутации на каждых двух инфицированных людей.
Общее количество инфекционных вирусных частиц, образующихся в ходе инфекции, составляет около 300 000 000 000. Если каждая из них испытывает в среднем 0,5 мутации в результате 5 циклов репликации, то оценка общего числа мутаций во время инфекции во всех вирусных частицах вместе взятых будет где–то от 100 000 до 100 000 000. Этот расчет не такой точный, как хотелось бы, но это то, что мы имеем, учитывая существующие данные.
РНК–код вируса содержит четыре основания: G,C,U и A — в геноме их насчитывается 30 000. Мутация может изменить любую из этих букв на любую из трех других букв в коде. Это дает в общей сложности около 100 000 возможных одиночных мутаций. С одной стороны, это означает, что все возможные одиночные изменения в РНК вируса уже произошли, и вероятность появления новых опасных штаммов со временем сильно уменьшается. С другой стороны, наибольшую опасность создают комбинации мутаций, и пока неизвестно, какие из них смогут сильно увеличить патогенность вируса.